Neue Veröffentlichung in "Nucl. Acids Res."

Neue Veröffentlichung in "J. Biol. Chem."

Die Spezifität von DNMT1 für hemimethylierte DNA ist eine zentrales Eigenschaft für die Vererbung von DNA-Methylierung. Wir untersuchen diese Eigenschaft in der kompetitiven Methylierungskinetik unter Verwendung hemimethylierter (HM), hemihydroxymethylierter (OH) und unmethylierter (UM) Substrate mit einzelnen CpG-Stellen in einem randomisierten Sequenzkontext. DNMT1 zeigt eine starke flankierende sequenzabhängige HM/UM-Spezifität von durchschnittlich dem 80-fachen, die auf langen hemimethylierten DNA-Substraten leicht verstärkt ist. Um diesen starken Effekt zu erklären, schlagen wir ein neues Modell vor, bei dem das Vorhandensein der 5mC-Methylgruppe die Konformation des DNMT1-DNA-Komplexes durch sterische Abstoßung in eine aktive Konformation ändert. Ein Vergleich der genomischen Methylierungsmuster von Maus-Zelllinien mit verschiedenen Deletionen von DNMTs und TETs mit unseren Daten ergab, dass das UM-Spezifitätsprofil am meisten mit zellulären Methylierungsmustern zusammenhängt, was darauf hindeutet, dass die de novo Methylierungsaktivität von DNMT1 das DNA-Methylom in diesen Zellen prägt.