Neue Veröffentlichung in "J. Mol. Biol."

DNA Methyltransferasen sind essentielle Enzyme in höheren Eukaryoten. Diese Enzyme interagieren mit ihren Ziel-DNA-Sequenzen in einen variablen Sequenzkontext. Dies führt zu starken und nicht gut verstandenen Auswirkungen der flankierenden Sequenzen auf ihre Aktivität und Spezifität. Diese Publikation beschreibt eine neuartige "deep enzymology"-Technologie zur Charakterisierung der flankierenden Sequenzpräferenzen von DNMTs, die in der Abteilung für Biochemie entwickelt wurde. Bei dieser Methode wird der Einfluss von Sequenzen, die Methylierungsstellen flankieren, untersucht, indem Substrate mit teilweise randomisierten Sequenzen verwendet und deren Methylierung untersucht wird. Der Ansatz führte zu interessanten und neuartigen mechanistischen Erkenntnissen, einschließlich der bemerkenswerten Beobachtung, dass flankierende abhängige Methylierungsmuster in menschlichen Zellen mit den in vitro-Präferenzen der DNMTs übereinstimmen. Darüber hinaus ermöglicht es auch die Untersuchung anderer mechanistischer Details, wie der Präferenz von DNMTs für die Co-Methylierung von CpG-Stellen in einem bestimmten Abstand.