Neue Veröffentlichung in "Mobile DNA"

Neue Veröffentlichung in "Mobile DNA"

Repetitive Elemente (RE) spielen eine wichtige Rolle bei der Zellfunktion und bei Krankheiten. In dieser Veröffentlichung stellen wir RepEnTools vor, ein neues, leistungsstarkes Softwarepaket für die genomweite RE-Analyse in ChIP-seq und ähnlichen Chromatin-Pulldown-Experimenten. Um die Leistung von RepEnTools zu demonstrieren, analysierten wir Chromatin-Pulldown-Daten der menschlichen UHRF1-TTD-Proteindomäne und entdeckten eine TTD-Anreicherung in jungen menschlichen RE in Regionen, die mit H3K4me1-K9me2/3-Modifikationen überlappen. RepEnTools kann RE-Anreicherungen schnell, effizient und genau analysieren und stellt Forschern ein aktuelles, zuverlässiges und zugängliches Tool für diese wichtige Art der Analyse zur Verfügung.