Neue Veröffentlichung in "Nucleic Acids Research"

In dieser Arbeit verwendeten wir die promiskuitive Chromatinbindung einer mit einem Zinkfinger fusionierten katalytischen Domäne der DNMT3A DNA Methyltransferase, um die DNA-Methylierung global in CpG Inseln (CGI) einzuführen. Mit diesem Ansatz konnten wir erstmals systematisch die Effizienz und Stabilität der eingeführten DNA-Methylierung und die daraus resultierenden Veränderungen des Epigenomnetzwerks auf genomweiter Ebene an mehreren tausend Loci untersuchen. Wir beobachteten eine effiziente Methylierung bei vielen tausend CGIs, aber einen raschen Verlust an den meisten Loci. Bei etwa 1000 CGIs, die eine Anreicherung der H3K27me3-Modifikation zeigten, wurde eine teilweise stabile Methylierung beobachtet. Global korrelierte die eingeführte DNA-Methylierung stark mit einer Abnahme der Genexpression, was auf einen direkten Gen-Silencing-Effekt der DNA-Methylierung in CGIs hinweist.