Neue Veröffentlichung in "Communications Biology"

TET-Dioxygenasen wandeln 5-Methylcytosin (5mC) vorzugsweise in einem CpG-Kontext in 5-Hydroxymethylcytosin (5hmC) und höher oxidierte Cytosin Formen um. Dieser Prozess leitet die DNA-Demethylierung ein, aber Einzelheiten der Auswirkungen der DNA-Sequenzen auf die TET-Aktivität sind unbekannt. Wir untersuchten die Oxidation von DNA-Substraten in randomisiertem Sequenzkontext und zeigen ausgeprägte bis zu 80-fache Auswirkungen flankierender Sequenzen auf die katalytischen Aktivitäten von TET-Enzymen. Präferenzen für flankierende TET-Sequenzen spiegeln sich in genomweiten und lokalen Mustern der 5hmC- und DNA-Demethylierung in menschlichen und Mauszellen wieder, was darauf hindeutet, dass sie genomische DNA-Modifikationsmuster in Kombination mit lokusspezifischem Targeting von TET-Enzymen beeinflussen.